这些年，随着经营规模的快速扩张，华灿光电毛利总额也大幅增长。2011年，华灿的毛利超过2亿元，近三年的毛利率为41.43%、52.22%和46%.这几年，华灿的毛利率也经历了一定的波动。
2010年，华灿的毛利率呈快速上升趋势，较2009年增长了10.79个百分点，这年毛利率提高较快的主要原因是由于：
一是自产外延片比例的提高。2010年，华灿的自产外延片占外延片总投料的比例由2009年的29.59%上升至40.76%。外延片是华灿生产成本中占比的原材料，约占营业成本的60%。由于外购外延片的成本较高，随着自产率的提升，营业成本下降较快，导致毛利率的提高。
二是技术进步和规模效应带来的成本下降。一方面，华灿技术的进步和生产工艺管理水平的不断提升，可有效提升芯片产品发光效率和产品良率，在保证产品性能和品质的前提下，可通过降低芯片尺寸等方式有效增加每片外延片的合格芯片产出数，从而有效降低了单颗芯片的生产成本；另一方面，随着华灿生产规模的扩大，规模效应得以不断体现，单位产品承担的固定成本和混合成本被摊薄，也可在一定程度上降低单位产品的生产成本。
而2011年，华灿的毛利率为46.00%，较2010年下降了6.22个百分点，但仍然保持在较高水平，去年毛利率下滑的主要是由于：
一是产品售价的下滑。2011年上半年，产品售价基本延续了2010年以来的稳定走势，但下半年价格下滑较快，全年折合为2英寸外延片产出芯片的售价由2010年的1,209.39元/片下降至2011年的1,135.03元/片，降幅为6.15%。
二是生产成本的上升。一方面，2011年前三季度华灿的绿光外延片主要依靠外购，且外购外延片的平均单价较高，使得绿光LED芯片的生产成本上升较快；另一方面，为实现外延片的全部自产，华灿2011年新增MOCVD
设备较多，由于新增MOCVD设备从投产到稳定量产需要一个过程，投产初期的良率仍有待提高，但每月的折旧费用保持不变，也在一定程度上影响了华灿的生产成本。目前，华灿光电的MOCVD设备已经陆续进入稳定量产期，且衬底片等原材料价格也有较大幅度下滑，未来通过实现外延片的全部自产对降低华灿生产成本的作用将日益明显。
拿华灿的毛利率对比同行业企业。2010年，由于LED行业整体属于爆发期，同LED外延芯片行业公司毛利率均有较大幅度提升。2011年，由于LED产业整体增速有所回稳，产品价格降幅明显，导致同行业公司毛利率大多出现了较大幅度下滑。去年，台湾同行业企业由于产能利用率显著不足，毛利率下降幅度尤为明显，部分企业的毛利率已经为负。
可以看出，国内外延芯片企业毛利率变动整体趋同性较强，但远优于台湾同行业企业。
